東至縣境古無大的建置。據(jù)《東流縣志》、《建德縣志》記載：虞、夏、商、周屬揚州地，秦屬九江郡、鄣郡。西漢分屬豫章郡彭澤、鄱陽縣和丹陽郡石城縣地。東漢不變。三國時屬吳國彭澤、丹陽、鄱陽三郡地。晉分屬豫章郡彭澤縣、鄱陽郡鄱陽縣、宣城郡石城縣地。南朝宋、齊，分屬揚州宣城郡石城、歷陵縣地和江州鄱陽郡鄱陽、潯陽郡彭澤縣地，梁、陳兩代在今縣境設(shè)南太原郡，置和城（今東流鎮(zhèn)）、晉陽（今張溪一帶）兩縣，屬南豫州。隋平陳后，太原郡及和城、晉陽兩縣并廢，地分屬潯陽郡龍城縣、九江郡彭澤縣和宣州郡秋浦縣、饒州鄱陽郡鄱陽縣。唐至德二年（757），分秋浦、鄱陽兩縣地在梅城置至德縣，《太平寰宇記》云：“以年號為名”，屬江南西道潯陽郡。乾元元年（758）屬饒州，永泰元年（765）改屬池州。會昌初（841—846），在原和城縣舊址建東流場，屬江州彭澤縣?！斗捷浖o(jì)要》載，五代楊吳順義二年（922）改至德縣為建德縣，仍屬池州，歷南唐不變。南唐保大十一年（953），升東流場為東流縣，屬江州?！睹饕唤y(tǒng)志》：“東流縣，以大江自湓城而下，逶迤東注，故名”。北宋太平興國三年（978），改屬池州池陽郡，并割貴池之晉陽鄉(xiāng)益東流。兩宋時東流、建德兩縣均屬江南東路池州池陽郡。元初屬江淮行省，元二十一年（1284）改屬江浙行省，元二十三年(1286)屬江浙行省池州路。明和清初屬池州府。明洪武初，池州路為九華府、華陽府，后仍改為池州府，直隸南京。清順治二年（1645）屬江南省，康熙十五年（1676）屬安徽省。雍正元年（1723）隸兩江總督，雍正十一年(1733)屬安徽省寧池太道。民國元年（1912）東流、建德兩縣直屬安徽省。民國3年1月（1914年1月），建德縣因與浙江省建德縣重名改為秋浦縣，民國3年6月至民國17年8月（1914年6月至1928年8月）屬安徽省蕪湖道。民國21年10月（1932年10月）秋浦縣復(fù)名至德縣，同月改屬安徽省第八專區(qū)。1949年4月22日、23日，東流、至德兩縣先后解放，同年5月13日同屬皖南行署池州專區(qū)。

中華人民共和國成立后，兩縣仍屬皖南行署池州專區(qū)。1953年2月24日改屬安徽省安慶專區(qū)。1959年5月15日，兩縣正式合并為東至縣，以堯渡鎮(zhèn)為縣城，仍屬安慶專區(qū)。1965年7月14日東至縣改屬池州專區(qū)，1971年3月29日專區(qū)改名為地區(qū)，隸屬不變。1980年1月29日改屬安慶行署。1988年9月2日，池州行署恢復(fù)，東至縣復(fù)屬池州行署。2000年6月25日，地級池州市成立，東至縣屬池州市至今。